El mes de novembre s’han iniciat les anàlisis per a la detecció i identificació de les variants genòmiques de preocupació o d'interès del SARS-CoV-2 a les mostres d’aigües residuals monitoritzades en el marc del Programa de vigilància del SARS-CoV-2 en aigües residuals de Catalunya per als anys 2021-2022
S’ha detectat la presència de mutacions exclusives de la variant Òmicron en mostres d’algunes EDARs des del passat 22 de novembre
El projecte SARSAIGUA, creat per l’Agència de Salut Pública de Catalunya i l’Agència Catalana de l’Aigua, ha detectat fins ara la presència de mutacions exclusives de la variant Òmicron del SARS-CoV-2 mitjançant seqüenciació en mostres de 6 estacions depuradores d’aigües residuals urbanes (EDAR) recollides les setmanes 47 (mostres del 22 de novembre de 2021) i 48 (mostres del 29 de novembre de 2021). En les mostres de les setmanes 49 (de 8 de desembre de 2021) i 50 (de 13 de desembre de 2021) s’ha detectat la presència d’una mutació signatura d’Òmicron mitjançant qPCR específica en 28 de 45 EDARs (62%). La seqüenciació d’aquestes mostres es troba en progrés i els resultats estaran disponibles en breu.
En el procés de dispersió i evolució de SARS-CoV-2 arreu del món s’han començat a descriure diverses variants del virus, algunes de les quals han estat detectades en mostres clíniques de malalts a Catalunya des de principis d’any. Les característiques d'algunes d'aquestes variants, a causa de la seva facilitat de propagació o la gravetat de la malaltia associada, poden constituir una amenaça per a la resposta contra el virus i les mesures de contenció i precaució aplicades pels diversos països i regions.
La vigilància del virus i les variants en les aigües residuals proporciona, tal com indica l’OMS, un indicador de l’estat i evolució de la pandèmia, i és una font d’informació útil per a la detecció anticipada de nous rebrots o l’entrada i circulació de noves variants al territori. Per aquest motiu, el Govern de Catalunya, mitjançant l’Acord GOV/169/2021, de 26 d'octubre, va aprovar l'ampliació del Programa de vigilància del SARS-CoV-2 en aigües residuals de Catalunya per als anys 2021-2022 amb el seguiment de variants.
El Programa té per objecte la detecció i identificació de les mutacions que puguin relacionar-se amb variants de preocupació o d'interès (VOC/VOI) del virus SARS-CoV-2 en les aigües d’entrada a les estacions depuradores d'aigües residuals urbanes (EDAR) de Catalunya abans de la seva depuració.
Aquesta vigilància i seguiment de les variants es realitza a partir de dos mètodes: d’una banda, la seqüenciació del genoma del virus SARS-CoV-2 en les mostres d’aigua residual i l'anàlisi bioinformàtic de les seqüències resultants i, d’altra banda, la detecció mitjançant la tècnica RT-qPCR de marcadors específics de les variants de les quals se’n fa el seguiment. Les anàlisis es realitzen al Laboratori de Biologia Molecular de Virus Entèrics i al Laboratori de Virus, Bacteris i Protozous d'Interès en Salut Pública i Seguretat Alimentària de la Universitat de Barcelona, i al Center for Omics Sciences (COS) d'Eurecat, tots tres laboratoris coordinats per l'Institut Català de Recerca de l'Aigua (ICRA).
Durant l'estiu del 2021 es va realitzar un estudi previ que va permetre determinar la potencialitat d'aquesta metodologia per estudiar la circulació de variants en el marc del Programa. Amb l'aprovació del nou Acord de Govern s'ha començat el seguiment sistemàtic de les variants a l’aigua d’entrada de totes les EDARs de la xarxa setmanalment.
Més informació sobre el Programa SARSAIGUA a https://sarsaigua.icra.cat/