Aquest apartat pretén aprofundir una mica més en la manera com portar a terme i valorar els controls que s'han de realitzar en les diferents fases d'elaboració dels menjars.
A continuació s'indiquen alguns dels possibles sistemes que cal seguir per controlar diferents aspectes que s'han exposat; això no vol dir que no n'hi pugui haver d'altres d'igualment útils i vàlids. També s'indiquen criteris sanitaris per decidir si els resultats de determinats controls són satisfactoris.
Molts d'aquests criteris estan regulats expressament en la normativa vigent i d'altres són bones pràctiques higièniques de manipulació reconegudes pels estudis i les publicacions que s'han fet fins ara sobre aquesta matèria.